Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPG1Q9Y678 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPG1Q9Y678 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPG1Q9Y678 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPG1Q9Y678 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPG1Q9Y678 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPG1Q9Y678 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPG1Q9Y678 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPG1Q9Y678 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPG1Q9Y678 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPG1Q9Y678 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPG1Q9Y678 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPG1Q9Y678 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPG1Q9Y678 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPG1Q9Y678 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPG1Q9Y678 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPG1Q9Y678 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPG1Q9Y678 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms