Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX10Q9Y5X0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX10Q9Y5X0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX10Q9Y5X0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX10Q9Y5X0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX10Q9Y5X0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX10Q9Y5X0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX10Q9Y5X0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX10Q9Y5X0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX10Q9Y5X0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNX10Q9Y5X0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX10Q9Y5X0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX10Q9Y5X0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX10Q9Y5X0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX10Q9Y5X0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX10Q9Y5X0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms