Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 CDC45-208ENST00000471470 857 ntTSL 513.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.96□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 412.58□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 38.5
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 523.76■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-221ENST00000488269 960 ntTSL 321.14■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 519.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-214ENST00000461052 1123 ntTSL 319.22■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-206ENST00000418750 586 ntTSL 419.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 218.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-213ENST00000460782 496 ntTSL 316.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ARHGAP4-209ENST00000422918 642 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ADAT2-201ENST00000237283 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.24□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 55.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 ADAT2-202ENST00000367593 524 ntTSL 34.57□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 37
UTP18Q9Y5J1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.679e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.319e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 521.87■■□□□ 1.099e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 219.79■□□□□ 0.769e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.568e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.188e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 514.33□□□□□ -0.128e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 36.2
UTP18Q9Y5J1 FAM182B-205ENST00000478164 992 ntTSL 516.07■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 35.9
UTP18Q9Y5J1 FAM182B-207ENST00000582267 832 ntTSL 514.99□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 35.9
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 216.41■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 35.7
UTP18Q9Y5J1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.044e-69■■■■■ 35.4
UTP18Q9Y5J1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.587e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.547e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-220ENST00000598108 1118 ntTSL 324.21■■□□□ 1.477e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.427e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.127e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.047e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.847e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.837e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.87e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.787e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-205ENST00000593337 633 ntTSL 319.67■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 ACOX3-205ENST00000510365 2050 ntTSL 519.66■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.727e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 219.55■□□□□ 0.727e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-216ENST00000597180 301 ntTSL 519.33■□□□□ 0.687e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-209ENST00000595034 739 ntTSL 319.31■□□□□ 0.687e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 318.97■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-230ENST00000601809 768 ntTSL 218.5■□□□□ 0.557e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-208ENST00000594387 800 ntTSL 318.35■□□□□ 0.537e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 417.99■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 217.96■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-210ENST00000590533 616 ntTSL 217.79■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 517.51■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 517.42■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-219ENST00000597636 2874 ntTSL 516.95■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 416.75■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-226ENST00000600453 700 ntTSL 316.46■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-212ENST00000591149 789 ntTSL 316.13■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 THOP1-207ENST00000587401 702 ntTSL 215.53■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 415.22■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-229ENST00000601373 680 ntTSL 215.02■□□□□ -07e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-212ENST00000596756 931 ntTSL 514.06□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.177e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 313.23□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 IRF3-206ENST00000593818 924 ntTSL 213.22□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 33.3
UTP18Q9Y5J1 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 33.3
Retrieved 100 of 2,623 protein–RNA pairs in 14.5 ms