Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF11Q9Y3C5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF11Q9Y3C5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF11Q9Y3C5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF11Q9Y3C5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF11Q9Y3C5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF11Q9Y3C5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF11Q9Y3C5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF11Q9Y3C5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF11Q9Y3C5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF11Q9Y3C5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF11Q9Y3C5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RNF11Q9Y3C5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF11Q9Y3C5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms