Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRG3Q9Y2Y8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRG3Q9Y2Y8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRG3Q9Y2Y8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRG3Q9Y2Y8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRG3Q9Y2Y8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG3Q9Y2Y8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG3Q9Y2Y8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG3Q9Y2Y8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG3Q9Y2Y8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG3Q9Y2Y8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG3Q9Y2Y8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG3Q9Y2Y8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG3Q9Y2Y8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG3Q9Y2Y8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG3Q9Y2Y8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG3Q9Y2Y8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG3Q9Y2Y8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG3Q9Y2Y8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRG3Q9Y2Y8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG3Q9Y2Y8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRG3Q9Y2Y8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRG3Q9Y2Y8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRG3Q9Y2Y8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRG3Q9Y2Y8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG3Q9Y2Y8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRG3Q9Y2Y8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG3Q9Y2Y8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRG3Q9Y2Y8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG3Q9Y2Y8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG3Q9Y2Y8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG3Q9Y2Y8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms