Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LEMD3Q9Y2U8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LEMD3Q9Y2U8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LEMD3Q9Y2U8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LEMD3Q9Y2U8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LEMD3Q9Y2U8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LEMD3Q9Y2U8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LEMD3Q9Y2U8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LEMD3Q9Y2U8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LEMD3Q9Y2U8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LEMD3Q9Y2U8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
LEMD3Q9Y2U8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LEMD3Q9Y2U8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LEMD3Q9Y2U8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LEMD3Q9Y2U8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LEMD3Q9Y2U8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LEMD3Q9Y2U8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LEMD3Q9Y2U8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LEMD3Q9Y2U8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LEMD3Q9Y2U8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LEMD3Q9Y2U8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LEMD3Q9Y2U8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LEMD3Q9Y2U8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LEMD3Q9Y2U8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LEMD3Q9Y2U8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LEMD3Q9Y2U8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms