Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPH3AQ9Y2J0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPH3AQ9Y2J0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPH3AQ9Y2J0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPH3AQ9Y2J0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPH3AQ9Y2J0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPH3AQ9Y2J0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPH3AQ9Y2J0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPH3AQ9Y2J0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPH3AQ9Y2J0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms