Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A6Q9Y289 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A6Q9Y289 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A6Q9Y289 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A6Q9Y289 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A6Q9Y289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A6Q9Y289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A6Q9Y289 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A6Q9Y289 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC5A6Q9Y289 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A6Q9Y289 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A6Q9Y289 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms