Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC2Q9Y235 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC2Q9Y235 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC2Q9Y235 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC2Q9Y235 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC2Q9Y235 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC2Q9Y235 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC2Q9Y235 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC2Q9Y235 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC2Q9Y235 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC2Q9Y235 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC2Q9Y235 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC2Q9Y235 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC2Q9Y235 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms