Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SATB2Q9UPW6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SATB2Q9UPW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SATB2Q9UPW6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SATB2Q9UPW6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SATB2Q9UPW6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SATB2Q9UPW6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB2Q9UPW6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SATB2Q9UPW6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SATB2Q9UPW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SATB2Q9UPW6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SATB2Q9UPW6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SATB2Q9UPW6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SATB2Q9UPW6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms