Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG5Q9UPR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMG5Q9UPR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMG5Q9UPR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMG5Q9UPR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG5Q9UPR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG5Q9UPR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMG5Q9UPR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMG5Q9UPR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMG5Q9UPR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMG5Q9UPR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMG5Q9UPR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMG5Q9UPR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMG5Q9UPR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMG5Q9UPR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms