Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGAP1Q9UPQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
AGAP1Q9UPQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGAP1Q9UPQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGAP1Q9UPQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AGAP1Q9UPQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
AGAP1Q9UPQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AGAP1Q9UPQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AGAP1Q9UPQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
AGAP1Q9UPQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AGAP1Q9UPQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AGAP1Q9UPQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms