Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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