Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HPCAL4Q9UM19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPCAL4Q9UM19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HPCAL4Q9UM19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HPCAL4Q9UM19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HPCAL4Q9UM19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HPCAL4Q9UM19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPCAL4Q9UM19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HPCAL4Q9UM19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HPCAL4Q9UM19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPCAL4Q9UM19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPCAL4Q9UM19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPCAL4Q9UM19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPCAL4Q9UM19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPCAL4Q9UM19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HPCAL4Q9UM19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPCAL4Q9UM19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms