Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERG28Q9UKR5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERG28Q9UKR5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERG28Q9UKR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERG28Q9UKR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERG28Q9UKR5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERG28Q9UKR5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERG28Q9UKR5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms