Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ADAM28Q9UKQ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ADAM28Q9UKQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ADAM28Q9UKQ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ADAM28Q9UKQ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ADAM28Q9UKQ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ADAM28Q9UKQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ADAM28Q9UKQ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ADAM28Q9UKQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ADAM28Q9UKQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ADAM28Q9UKQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ADAM28Q9UKQ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ADAM28Q9UKQ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ADAM28Q9UKQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ADAM28Q9UKQ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ADAM28Q9UKQ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ADAM28Q9UKQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ADAM28Q9UKQ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ADAM28Q9UKQ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ADAM28Q9UKQ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ADAM28Q9UKQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ADAM28Q9UKQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ADAM28Q9UKQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ADAM28Q9UKQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ADAM28Q9UKQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ADAM28Q9UKQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ADAM28Q9UKQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ADAM28Q9UKQ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms