Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MBD1Q9UIS9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD1Q9UIS9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MBD1Q9UIS9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MBD1Q9UIS9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD1Q9UIS9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD1Q9UIS9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD1Q9UIS9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD1Q9UIS9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD1Q9UIS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD1Q9UIS9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD1Q9UIS9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD1Q9UIS9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD1Q9UIS9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms