Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGGBP1Q9UFW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGGBP1Q9UFW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGGBP1Q9UFW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGGBP1Q9UFW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGGBP1Q9UFW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGGBP1Q9UFW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGGBP1Q9UFW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGGBP1Q9UFW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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