Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT8Q9UFF9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT8Q9UFF9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT8Q9UFF9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT8Q9UFF9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT8Q9UFF9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNOT8Q9UFF9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CNOT8Q9UFF9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNOT8Q9UFF9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT8Q9UFF9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT8Q9UFF9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT8Q9UFF9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNOT8Q9UFF9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNOT8Q9UFF9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms