Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNAL1Q9UBT7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNAL1Q9UBT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNAL1Q9UBT7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNAL1Q9UBT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNAL1Q9UBT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNAL1Q9UBT7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNAL1Q9UBT7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNAL1Q9UBT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNAL1Q9UBT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNAL1Q9UBT7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms