Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF7Q9UBF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF7Q9UBF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF7Q9UBF6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF7Q9UBF6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF7Q9UBF6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF7Q9UBF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF7Q9UBF6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF7Q9UBF6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF7Q9UBF6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF7Q9UBF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms