Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPG2Q9UBF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPG2Q9UBF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPG2Q9UBF2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPG2Q9UBF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPG2Q9UBF2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPG2Q9UBF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPG2Q9UBF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPG2Q9UBF2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COPG2Q9UBF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPG2Q9UBF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPG2Q9UBF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPG2Q9UBF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPG2Q9UBF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPG2Q9UBF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPG2Q9UBF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPG2Q9UBF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPG2Q9UBF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPG2Q9UBF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COPG2Q9UBF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPG2Q9UBF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPG2Q9UBF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms