Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD7Q9P2D1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD7Q9P2D1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CHD7Q9P2D1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD7Q9P2D1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CHD7Q9P2D1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD7Q9P2D1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD7Q9P2D1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD7Q9P2D1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD7Q9P2D1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD7Q9P2D1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHD7Q9P2D1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD7Q9P2D1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD7Q9P2D1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHD7Q9P2D1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CHD7Q9P2D1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHD7Q9P2D1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD7Q9P2D1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD7Q9P2D1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHD7Q9P2D1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD7Q9P2D1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHD7Q9P2D1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHD7Q9P2D1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHD7Q9P2D1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHD7Q9P2D1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms