Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDUFA13Q9P0J0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFA13Q9P0J0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFA13Q9P0J0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDUFA13Q9P0J0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDUFA13Q9P0J0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDUFA13Q9P0J0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFA13Q9P0J0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFA13Q9P0J0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFA13Q9P0J0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFA13Q9P0J0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFA13Q9P0J0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFA13Q9P0J0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFA13Q9P0J0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA13Q9P0J0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA13Q9P0J0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA13Q9P0J0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA13Q9P0J0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms