Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNIH4Q9P003 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNIH4Q9P003 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNIH4Q9P003 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNIH4Q9P003 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNIH4Q9P003 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNIH4Q9P003 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNIH4Q9P003 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNIH4Q9P003 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNIH4Q9P003 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNIH4Q9P003 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms