Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREM2Q9NZC2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREM2Q9NZC2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREM2Q9NZC2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TREM2Q9NZC2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREM2Q9NZC2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TREM2Q9NZC2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREM2Q9NZC2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREM2Q9NZC2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms