Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAR1Q9NY12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAR1Q9NY12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAR1Q9NY12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAR1Q9NY12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAR1Q9NY12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAR1Q9NY12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAR1Q9NY12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GAR1Q9NY12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms