Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX18Q9NVP1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX18Q9NVP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX18Q9NVP1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX18Q9NVP1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX18Q9NVP1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX18Q9NVP1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX18Q9NVP1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX18Q9NVP1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms