Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FBXO28Q9NVF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FBXO28Q9NVF7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
FBXO28Q9NVF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FBXO28Q9NVF7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FBXO28Q9NVF7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FBXO28Q9NVF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FBXO28Q9NVF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
FBXO28Q9NVF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO28Q9NVF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO28Q9NVF7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FBXO28Q9NVF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FBXO28Q9NVF7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FBXO28Q9NVF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FBXO28Q9NVF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FBXO28Q9NVF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO28Q9NVF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FBXO28Q9NVF7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FBXO28Q9NVF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FBXO28Q9NVF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FBXO28Q9NVF7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO28Q9NVF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
FBXO28Q9NVF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms