Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERTAD4Q9NUC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERTAD4Q9NUC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERTAD4Q9NUC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERTAD4Q9NUC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERTAD4Q9NUC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERTAD4Q9NUC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERTAD4Q9NUC0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERTAD4Q9NUC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERTAD4Q9NUC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERTAD4Q9NUC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms