Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SALL1Q9NSC2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SALL1Q9NSC2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SALL1Q9NSC2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SALL1Q9NSC2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SALL1Q9NSC2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL1Q9NSC2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SALL1Q9NSC2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SALL1Q9NSC2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SALL1Q9NSC2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SALL1Q9NSC2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SALL1Q9NSC2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SALL1Q9NSC2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SALL1Q9NSC2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SALL1Q9NSC2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SALL1Q9NSC2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SALL1Q9NSC2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SALL1Q9NSC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SALL1Q9NSC2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SALL1Q9NSC2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SALL1Q9NSC2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SALL1Q9NSC2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SALL1Q9NSC2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SALL1Q9NSC2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SALL1Q9NSC2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SALL1Q9NSC2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SALL1Q9NSC2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SALL1Q9NSC2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms