Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THSD1Q9NS62 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
THSD1Q9NS62 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
THSD1Q9NS62 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD1Q9NS62 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
THSD1Q9NS62 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THSD1Q9NS62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THSD1Q9NS62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THSD1Q9NS62 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
THSD1Q9NS62 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms