Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDHAF3Q9NRP4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHAF3Q9NRP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHAF3Q9NRP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDHAF3Q9NRP4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF3Q9NRP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF3Q9NRP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF3Q9NRP4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF3Q9NRP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF3Q9NRP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF3Q9NRP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF3Q9NRP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF3Q9NRP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF3Q9NRP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms