Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP26Q9NRE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP26Q9NRE1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP26Q9NRE1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP26Q9NRE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP26Q9NRE1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP26Q9NRE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP26Q9NRE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP26Q9NRE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP26Q9NRE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms