Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF4Q9NR80 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF4Q9NR80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF4Q9NR80 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF4Q9NR80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF4Q9NR80 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF4Q9NR80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF4Q9NR80 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF4Q9NR80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF4Q9NR80 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF4Q9NR80 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF4Q9NR80 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF4Q9NR80 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF4Q9NR80 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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