Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD248Q9HCU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD248Q9HCU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD248Q9HCU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD248Q9HCU0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD248Q9HCU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD248Q9HCU0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD248Q9HCU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD248Q9HCU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD248Q9HCU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD248Q9HCU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CD248Q9HCU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CD248Q9HCU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD248Q9HCU0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD248Q9HCU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms