Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PABPC3Q9H361 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC3Q9H361 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PABPC3Q9H361 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PABPC3Q9H361 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC3Q9H361 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PABPC3Q9H361 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PABPC3Q9H361 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PABPC3Q9H361 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PABPC3Q9H361 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC3Q9H361 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC3Q9H361 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PABPC3Q9H361 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC3Q9H361 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC3Q9H361 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC3Q9H361 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms