Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2B2

SYT4, Synaptotagmin-4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT4Q9H2B2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT4Q9H2B2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT4Q9H2B2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT4Q9H2B2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT4Q9H2B2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT4Q9H2B2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT4Q9H2B2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT4Q9H2B2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT4Q9H2B2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT4Q9H2B2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT4Q9H2B2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT4Q9H2B2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT4Q9H2B2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms