Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf54Q9H0W9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf54Q9H0W9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf54Q9H0W9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf54Q9H0W9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf54Q9H0W9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf54Q9H0W9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf54Q9H0W9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C11orf54Q9H0W9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C11orf54Q9H0W9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf54Q9H0W9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf54Q9H0W9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf54Q9H0W9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C11orf54Q9H0W9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf54Q9H0W9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf54Q9H0W9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms