Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GPR88Q9GZN0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPR88Q9GZN0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPR88Q9GZN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPR88Q9GZN0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPR88Q9GZN0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPR88Q9GZN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPR88Q9GZN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GPR88Q9GZN0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPR88Q9GZN0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPR88Q9GZN0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPR88Q9GZN0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPR88Q9GZN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPR88Q9GZN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPR88Q9GZN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPR88Q9GZN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms