Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2J2Q9GZM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2J2Q9GZM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2J2Q9GZM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2J2Q9GZM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2J2Q9GZM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2J2Q9GZM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2J2Q9GZM3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2J2Q9GZM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2J2Q9GZM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms