Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT23Q9C075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT23Q9C075 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT23Q9C075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT23Q9C075 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT23Q9C075 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KRT23Q9C075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT23Q9C075 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT23Q9C075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT23Q9C075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT23Q9C075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT23Q9C075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT23Q9C075 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT23Q9C075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT23Q9C075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT23Q9C075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT23Q9C075 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms