Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP3Q9BZS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXP3Q9BZS1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXP3Q9BZS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXP3Q9BZS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXP3Q9BZS1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXP3Q9BZS1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXP3Q9BZS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXP3Q9BZS1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXP3Q9BZS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXP3Q9BZS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXP3Q9BZS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXP3Q9BZS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXP3Q9BZS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXP3Q9BZS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXP3Q9BZS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXP3Q9BZS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms