Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTPBP4Q9BZE4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTPBP4Q9BZE4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTPBP4Q9BZE4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTPBP4Q9BZE4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GTPBP4Q9BZE4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTPBP4Q9BZE4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GTPBP4Q9BZE4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTPBP4Q9BZE4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTPBP4Q9BZE4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTPBP4Q9BZE4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTPBP4Q9BZE4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTPBP4Q9BZE4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms