Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM55Q9BYV6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM55Q9BYV6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM55Q9BYV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM55Q9BYV6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM55Q9BYV6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM55Q9BYV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM55Q9BYV6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM55Q9BYV6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM55Q9BYV6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM55Q9BYV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM55Q9BYV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM55Q9BYV6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM55Q9BYV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM55Q9BYV6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms