Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC46A2Q9BY10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC46A2Q9BY10 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC46A2Q9BY10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC46A2Q9BY10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC46A2Q9BY10 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC46A2Q9BY10 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC46A2Q9BY10 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC46A2Q9BY10 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC46A2Q9BY10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC46A2Q9BY10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC46A2Q9BY10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC46A2Q9BY10 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC46A2Q9BY10 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC46A2Q9BY10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC46A2Q9BY10 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC46A2Q9BY10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC46A2Q9BY10 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC46A2Q9BY10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC46A2Q9BY10 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC46A2Q9BY10 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC46A2Q9BY10 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC46A2Q9BY10 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC46A2Q9BY10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC46A2Q9BY10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC46A2Q9BY10 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC46A2Q9BY10 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms