Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVK-6Q9BXR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVK-6Q9BXR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-6Q9BXR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERVK-6Q9BXR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-6Q9BXR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVK-6Q9BXR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-6Q9BXR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-6Q9BXR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-6Q9BXR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-6Q9BXR3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-6Q9BXR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-6Q9BXR3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVK-6Q9BXR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-6Q9BXR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms