Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
C1QTNF1Q9BXJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms