Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD2AQ9BW72 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD2AQ9BW72 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD2AQ9BW72 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD2AQ9BW72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIGD2AQ9BW72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIGD2AQ9BW72 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD2AQ9BW72 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms