Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD3Q9BV44 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD3Q9BV44 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD3Q9BV44 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD3Q9BV44 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD3Q9BV44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD3Q9BV44 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD3Q9BV44 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
THUMPD3Q9BV44 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THUMPD3Q9BV44 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
THUMPD3Q9BV44 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THUMPD3Q9BV44 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THUMPD3Q9BV44 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THUMPD3Q9BV44 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
THUMPD3Q9BV44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THUMPD3Q9BV44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD3Q9BV44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD3Q9BV44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THUMPD3Q9BV44 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD3Q9BV44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3Q9BV44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD3Q9BV44 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms